Els Aiguamolls de l'Empordà són una de les principals zones humides de Catalunya, juntament amb els deltes de l'Ebre i el Llobregat.
Es troben ubicats a la plana empordanesa, entre les desembocadures dels rius Fluvià i Muga, en un espai caracteritzat pels cursos fluvials actuals, les antigues desembocadures dels rius, i els sistemes de canalització i rec dels conreus que històricament s'han donat en aquest lloc ric en aigua dolça.
A més de la figura coneguda de Parc Natural, hi trobem les reserves naturals integrals (màxim nivell de protecció natural a la legislació catalana) de les Llaunes i dels Estanys.

El logotip del parc és el xarrasclet, en empordanès ànec roncaire (Anas querquedula). Es va agafar com a símbol perquè, en el moment de la creació del parc, era l’única espècie d’au aquàtica que de tota la Península Ibèrica només criava regularment als aiguamolls empordanesos.
El parc natural dels Aiguamolls de l’Empordà va ser creat el 28 d’octubre de 1983 mitjançant la Llei 23/1983, de declaració de paratges naturals d’interès nacional i de reserves integrals zoològiques i botàniques dels Aiguamolls de l’Empordà.
El 17 d’abril de 1984 s’aprova el Decret 136/1984, de desplegament de la Llei 21/1983.

El Parc Natural dels Aiguamolls de l’Empordà està situat dins la badia de Roses, a la comarca de l’Alt Empordà, província de Girona.
4.721,55 hectàrees de parc natural.
Inclou 824,54 hectàrees de la reserves naturals integrals (Els Estanys, Les Llacunes i l’Illa de Caramany) i 9,28 hectàrees de la reserva natural parcial Illa de Caramany.
Província: Girona
Vegueria: Girona
Comarca: Alt Empordà
Superfície del Parc a cada municipi:
| Castelló d'Empúries | 2.720,29 ha |
| l'Armentera | 31,74 ha |
| l'Escala | 106,74 ha |
| Palau-saverdera | 449,27 ha |
| Pau | 221,74 ha |
| Peralada | 425,17 ha |
| Roses | 51,10 ha |
| Sant Pere Pescador | 595,66 ha |
Tots els nuclis de població estan exclosos dels límits del Parc.
El volum de població regular que viu en els municipis amb territori al parc és de 49.960 habitants corresponents a 9 municipis. Aquesta xifra es pot arribar a triplicar durant el període estival.
Habitants per municipi
12.220 Castelló d'Empúries
865 l'Armentera
10.387 l'Escala
1.475 Palau-saverdera
563 Pau
173 Pedret i Marzà
1.826 Peralada
20.418 Roses
2.033 Sant Pere Pescador
Font: Padró continu 2010. Institut d'Estadística de Catalunya. www.idescat.cat
Un 80 % del territori del parc és de propietat privada i la resta és propietat de la Generalitat de Catalunya.
Els Aiguamolls de l’Empordà són un dels espais naturals de Catalunya en que s’observa una major varietat d’espècies animals.
Els ocells fan dels Aiguamolls el seu refugi i el lloc de descans i en són més de 300 espècies, moltes d’elles protegides i d’una gran bellesa.
Fins ara han estat citades 329 espècies d’ocells, de les quals 82 hi nidifiquen de manera regular.
Òrgan gestor
Unitat de gestió del Parc Natural dels Aiguamolls de l'Empordà - Servei d’Espais Naturals Protegits - Direcció General del Medi Natural i Biodiversitat - Departament d'Agricultura, Ramaderia, Pesca, Alimentació i Medi Natural - Generalitat de Catalunya
Òrgan rector
Junta Rectora del parc (22 membres)
1983 Parc natural dels Aiguamolls de l'Empordà
1983 Reserva integral I dels Aiguamolls de l'Empordà, Els Estanys
1983 Reserva integral II dels Aiguamolls de l'Empordà, Les Llaunes
1983 Reserva integral III dels Aiguamolls de l'Empordà, Illa de Caramany
1983 Reserva natural parcial Illa de Caramany
El Cortalet
Ctra.de Sant Pere Pescador a Castelló d’Empúries (GIV-6216, Km 13)
17486 Castelló d’Empúries
Telèfon: 972 45 42 22
Altres punts d’informació
Castelló d’Empúries
Plaça dels Homes, 1
Telèfon: 972 15 62 33
Empuriabrava
Centre Cívic
Av. Pompeu Fabra
Telèfon: 972 45 08 02
Sant Pere Pescador
C/ Doctor Josep Vidal, 4
Telèfons: 972 52 05 35 / 972 52 00 50
L’Escala
Plaça de les Escoles, 1
Telèfon: 972 77 06 03
Peralada
Centre Cultural Sant Domènec
Plaça Peixateria, 2
Telèfon: 972 53 88 40
Figueres
Plaça del Sol
Telèfon: 972 50 31 55
Roses
Av. de Rhode, 101
Telèfon: 972 25 73 31